Вариантный штамм вируса SARS-CoV-2, ассоциированный с норкой – Дания - Дания

Since June 2020, Danish authorities have reported an extensive spread of SARS-CoV-2, the virus that causes COVID-19, on mink farms in Denmark.

С июня 2020 г. власти Дании регистрируют активное распространение вируса SARS‑CoV‑2, который вызывает заболевание COVID‑19, на фермах по разведению норок. Пятого ноября руководящие органы общественного здравоохранения Дании сообщили о выявлении у 12 человек в Северной Ютландии за период с августа по сентябрь 2020 г. заболевания, вызванного вариантным штаммом вируса SARS‑CoV-2, который ассоциирован с норкой и обладает ранее не наблюдавшимися мутациями (так называемый «кластер 5»)
К настоящему времени у различных вариантов вируса SARS‑CoV-2, которые параллельно циркулируют в популяциях норки и человека, Управлением общественного здравоохранения (Statens Serum Institut) Дании было выявлено семь уникальных мутаций вирусного спайк‑белка. Специалисты Управления получили культуру вариантного штамма вируса «кластер 5», который характеризуется изменениями четырех участков аминокислотной последовательности спайк‑белка, был выявлен в популяции норок и выделен у 12 заболевших в Северной Ютландии. По предварительным данным, антитела менее эффективно нейтрализуют вирус, принадлежащий к «кластеру 5», что требует дополнительного изучения. 
После введения властями Дании мер охраны общественного здоровья заболеваемость COVID-19 в Северной Ютландии снизилась со 100 случаев на 100 000 населения (зарегистрировано на неделе со 2 ноября, 45‑я неделя) до 60 случаев на 100 000 населения (зарегистрировано на неделе с 16 ноября, 47‑я неделя). За минувшие недели власти Дании провели массовое тестирование 111 447 лиц, проживающих в Северной Ютландии, с применением метода полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР) и планируют выполнение генетического секвенирования всех образцов с положительным результатом тестирования. 
По сравнению с октябрем 2020 г., когда было зафиксировано 200 случаев заболевания человека, эпидемиологически связанных с разведением норок, в ноябре 2020 г. данный показатель возрос до 349 случаев. С июня 2020 г. было зарегистрировано в общей сложности 644 случая заболевания человека, в которых прослеживается эпидемическая связь с разведением норок. Кроме того, было зарегистрировано не менее 338 случаев заболевания лиц, занятых на ошкуривании норок, на шести предприятиях и двух небольших производственных площадках, что свидетельствует о высоком риске заражения COVID-19 для лиц, занимающихся разведением, забоем и ошкуриванием норок. По состоянию на 1 декабря 2020 г. было затронуто в общей сложности 289 ферм по разведению норок, что составляет порядка 20% всех ферм по разведению норок в Дании.
Начиная с 6 июня 2020 г. (24‑я неделя) до окончания недели с 16 ноября 2020 г. (47‑я неделя) было выполнено полногеномное секвенирование 10 386 образцов материала, положительных на COVID-19, которые были получены от различных пациентов, что составило 17,6% всех положительных образцов в соответствующий период. Было выявлено 750 образцов материала, содержащих вариантный штамм вируса, ассоциированный с норкой. Кроме того, недавно в Южной Дании было обнаружено по меньшей мере два вариантных штамма нового вируса SARS-CoV-2, генетически не связанных с исходным вариантным штаммом, ассоциированным с норкой, в Дании. 
В северных районах страны доля проб, содержащих ассоциированный с норкой вариантный штамм вируса SARS‑CoV-2, в общей структуре исследованных образцов снизилась с 60% и 51% на 41‑й и 42‑й неделе соответственно до 26% и 31% на 46‑й и 47‑й неделе; в центральных районах Дании этот показатель возрос с уровня около 3% на 41‑й и 42‑й неделе до уровня выше 30% на 46‑й и 47‑й неделе; в Южной Дании эта доля увеличилась с 0% на 41‑й и 42‑й неделе до 11% и 21% на 46‑й и 47‑й неделе соответственно, при этом следует заметить, что частота и порядок выполнения секвенирования в разных регионах отличаются. В районах, в которых фермы по разведению норок не затронуты инфекцией, случаи заражения человека вариантным штаммом, ассоциированным с норкой, имели место в единичных случаях. По состоянию на 20 ноября в исследованиях с применением генетического секвенирования не было выявлено новых случаев заражения человека штаммом «кластер 5», что позволило руководящим органам сделать вывод о прекращении циркуляции вариантного штамма «кластер 5» среди населения. 
Случаи заражения норок вирусом SARS-CoV-2 были описаны ранее, в том числе в апреле 2020 г. во время двух вспышек на крупных фермах по разведению норок в Нидерландах. Кроме того, в Нидерландах описаны случаи заражения человека штаммами вируса SARS-CoV-2, ассоциированными с норками и не относящимися к «кластеру 5». На сегодняшний день восемь стран, а именно Дания, Литва, Нидерланды, Испания, Швеция, Италия, Греция и Соединенные Штаты Америки, сообщили во Всемирную организацию по охране здоровья животных (МЭБ) о выявлении SARS-CoV-2 у норок на фермах. 

Четвертого ноября 2020 г. Дания приняла решение о забое всех норок, находящихся на фермах страны. Это решение было принято на основании данных о том, что предупредить передачу инфекции между фермами и от животных к человеку невозможно, в связи с чем норки являются резервуаром, наличие которого способствует дальнейшей передаче инфекции в Дании. Пятого ноября в пострадавших районах Северной Ютландии были введены ограничения на перемещение. Шестого ноября Дания разместила на платформе GISAID сведения о полной геномной последовательности вируса SARS-CoV-2, выделенного у людей, а 18 ноября – также 133 последовательности вируса, выделенного у норок. Девятнадцатого ноября 2020 г. в связи со снижением заболеваемости и отсутствием новых случаев инфекции, вызванных вариантным штаммом «кластер 5» в затронутых районах, в Северной Ютландии были сняты введенные ограничения.
К 25 ноября норки, находящиеся на всех 289 пострадавших фермах, а также хозяйствах в обозначенной зоне, были забиты. Кроме того, был введен запрет на разведение норок в хозяйствах на территории Дании до 31 декабря 2021 г., включая импорт и экспорт живых норок. Для смягчения последствий данного решения был подготовлен пакет мер экономической поддержки.
Власти Дании продолжают взаимодействовать с рабочей группой ВОЗ по эволюции вируса SARS-CoV-2 и договорились об обмене сведениями, касающимися вариантного штамма вируса SARS-CoV-2 «кластер 5», с Сетью референс‑лабораторий для тестирования на COVID-19 в целях дальнейшего проведения исследований и тестирования. 

Полагают, что с течением времени все вирусы, в том числе SARS-CoV-2, изменяются. Штаммы вирусов SARS-CoV-2, которые поражают норок и впоследствии – человека, могли приобрести уникальные мутации для адаптации к организму хозяина‑норки. Для полноценного понимания таких параметров, связанных с новыми вариантными штаммами вируса SARS-CoV-2, как способность к распространению в популяции, клиническая картина и возможность эффективной диагностики заболевания, возможность лечения и вакцинации, необходимы усовершенствованные методы лабораторных исследований. Эти исследования занимают время и проводятся в тесном сотрудничестве между различными исследовательскими группами. 
Благодаря мерам для защиты здоровья населения и социальным мерам, введенным Данией, удалось добиться позитивных сдвигов, тем не менее по‑прежнему вызывают обеспокоенность факты обнаружения в Центральной Ютландии других вариантных штаммов, ассоциированных с норками, у заболевших людей, а также порядка 200 случаев заболевания у рабочих.

Это событие подчеркивает важную роль, которую может сыграть поголовье норок на фермах в условиях продолжающейся передачи SARS-CoV-2, а также важнейшее значение эффективного эпиднадзора, отбора проб и секвенирования для определения данных вирусов на основании подхода «Единое здравоохранение», особенно в районах, в которых выявлены такие животные-резервуары. Предварительные результаты, полученные в Дании, имеют глобальную значимость, и ВОЗ признает важное значение оперативного обмена эпидемиологическими и вирусологическими данными, а также информацией о полной геномной последовательности с другими странами и исследовательскими группами, в том числе с помощью общедоступных платформ, таких как GISAID.
ВОЗ рекомендует следующие меры:

• провести дальнейшие вирусологические исследования в целях понимания специфических мутаций, описанных в Дании, и дальнейшего изучения любых изменений вируса с точки зрения его способности распространяться в популяции и вызывать заболевание;
• по возможности нарастить масштаб секвенирования образцов материала, полученных от человека и животных, особенно в странах, в которых распространено пушное звероводство, в том числе разведение норок, на предмет заражения вирусом SARS-CoV-2 и обеспечить обмен данными о секвенировании даже при выявлении ранее описанных мутаций;
• усилить эпиднадзор за случаями заражения COVID-19 в странах при контакте между животными и людьми в местах обитания соответствующих животных‑резервуаров, включая предприятия пушного звероводства и фермы по разведению норок;
• усилить в странах меры биобезопасности и биозащиты фермерских хозяйств в отношении установленных животных‑резервуаров для снижения риска зоонозных заболеваний, связанных с SARS-CoV-2. Имеется в виду в том числе реализация мер профилактики инфекций и инфекционного контроля в отношении работников животноводства, посетителей ферм и лиц, занятых в разведении или забое животных;
• напомнить общественности и работникам здравоохранения о базовых принципах сокращения совокупного риска передачи острых респираторных заболеваний за счет следующих действий:
• избегание близкого контакта с лицами, страдающими острыми респираторными инфекциями;
• частое мытье рук, особенно после непосредственного контакта с больными или предметами окружающей их обстановки;
• избегание контакта с сельскохозяйственными или дикими животными без применения средств защиты;
• при появлении симптомов острой респираторной инфекции — соблюдение кашлевого этикета, например поддержание безопасной дистанции, прикрывание носа и рта при кашле и чихании одноразовыми салфетками или платками, а также мытье рук;
• повышение эффективности стандартных мер профилактики инфекций и инфекционного контроля в стационарных медицинских учреждениях, особенно в отделениях неотложной помощи.

ВОЗ рекомендует принимать перечисленные выше меры всем лицам, совершающим поездки. При появлении во время или после поездки симптомов, указывающих на респираторное заболевание, рекомендуется обратиться за медицинской помощью и проинформировать медицинского специалиста об анамнезе поездок. Органам здравоохранения следует взаимодействовать с организациями сферы путешествий, туризма и транспорта для распространения через медицинские учреждения, обслуживающие туристов, туристические бюро, операторов пассажирских перевозок и пункты пересечения границы информации о способах уменьшения риска острых респираторных инфекций среди лиц, совершающих поездки.
С учетом имеющейся на сегодняшний день информации о данном событии ВОЗ не рекомендует вводить в отношении Дании какие-либо ограничения на поездки или торговлю.
Для получения дополнительной информации см.:
Вариантный штамм вируса SARS-CoV-2, ассоциированный с норкой – Дания
Информационная панель Всемирной организации здравоохранения для наблюдения за COVID‑19 (на англ. языке)
Еженедельная эпидемиологическая сводка и бюллетень ВОЗ по проблеме COVID-19 (на англ. языке)
Тематический обзор о COVID-19
Механизмы передачи вируса SARS-CoV-2 и их значение для выбора мер профилактики
Санитарно-эпидемиологические аспекты возобновления международных пассажирских перевозок
Шестое обновление информации МЭБ по ситуации с распространением COVID-19 в популяции норок в Дании (на англ. языке)
Сводка технической информации МЭБ по проблеме SARS‑CoV-2 в популяции животных
МЭБ: вопросы и ответы по проблеме COVID-19
Экспозиция человека или животных инфекцией SARS‑CoV-2 при контакте с дикими, сельскохозяйственными, домашними и водными животными (документ ФАО на англ. языке)

Тематический обзор о COVID-19
Механизмы передачи вируса SARS-CoV-2 и их значение для выбора мер профилактики
Санитарно-эпидемиологические аспекты возобновления международных пассажирских перевозок